Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALX1Q15699 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALX1Q15699 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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