Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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