Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIP10Q15642 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms