Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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