Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF1Q15637 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF1Q15637 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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