Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAM1Q15629 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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