Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SURF1Q15526 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SURF1Q15526 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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