Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKIV2LQ15477 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKIV2LQ15477 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms