Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PUM3Q15397 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PUM3Q15397 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms