Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NECTIN1Q15223 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN1Q15223 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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