Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFIXQ14938 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFIXQ14938 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFIXQ14938 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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