Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MDC1Q14676 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDC1Q14676 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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