Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.087e-8■■□□□ 12.9
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PUM1Q14671 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.287e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PRPF8-210ENST00000574217 310 ntTSL 26.53□□□□□ -1.367e-8■■□□□ 12.9
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PUM1Q14671 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-8■■□□□ 12.9
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PUM1Q14671 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 517.75■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 12.8
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PUM1Q14671 INTS11-236ENST00000528879 1524 ntTSL 516.1■□□□□ 0.171e-6■■□□□ 12.8
PUM1Q14671 INTS11-227ENST00000525603 738 ntTSL 315.45■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 12.8
PUM1Q14671 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 414.52□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 12.8
PUM1Q14671 INTS11-229ENST00000526113 591 ntTSL 514.02□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 12.8
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PUM1Q14671 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-9■■□□□ 12.8
PUM1Q14671 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-9■■□□□ 12.8
PUM1Q14671 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)23.88■■□□□ 1.415e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.075e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.175e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.635e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 39.48□□□□□ -0.895e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.915e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 NUDC-204ENST00000484772 607 ntTSL 212.8□□□□□ -0.361e-7■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 DHX38-214ENST00000579387 2258 ntTSL 516.65■□□□□ 0.261e-8■■□□□ 12.7
PUM1Q14671 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-8■■□□□ 12.7
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