Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IHHQ14623 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IHHQ14623 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IHHQ14623 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IHHQ14623 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IHHQ14623 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IHHQ14623 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IHHQ14623 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IHHQ14623 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IHHQ14623 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IHHQ14623 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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