Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP5Q14008 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms