Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA9Q13797 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA9Q13797 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA9Q13797 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA9Q13797 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA9Q13797 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA9Q13797 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA9Q13797 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA9Q13797 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA9Q13797 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms