Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP1A4Q13733 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP1A4Q13733 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms