Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PICALMQ13492 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PICALMQ13492 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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