Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MSLNQ13421 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MSLNQ13421 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
MSLNQ13421 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MSLNQ13421 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MSLNQ13421 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MSLNQ13421 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MSLNQ13421 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MSLNQ13421 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MSLNQ13421 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MSLNQ13421 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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