Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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PTPRSQ13332 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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PTPRSQ13332 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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PTPRSQ13332 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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PTPRSQ13332 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRSQ13332 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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PTPRSQ13332 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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PTPRSQ13332 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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PTPRSQ13332 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRSQ13332 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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