Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SGCGQ13326 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SGCGQ13326 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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