Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CLN3Q13286 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CLN3Q13286 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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