Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTGDRQ13258 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDRQ13258 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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