Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRSF6Q13247 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SRSF6Q13247 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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