Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME3Q13232 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME3Q13232 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME3Q13232 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME3Q13232 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NME3Q13232 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NME3Q13232 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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