Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CBX3Q13185 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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