Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPA4Q13156 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPA4Q13156 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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