Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1BQ13112 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHAF1BQ13112 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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