Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECH1Q13011 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECH1Q13011 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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