Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSTF3Q12996 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms