Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BNIP3Q12983 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BNIP3Q12983 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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