Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BNIP1Q12981 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BNIP1Q12981 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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