Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXC1Q12948 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXC1Q12948 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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