Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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RAB40BQ12829 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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RAB40BQ12829 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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RAB40BQ12829 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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RAB40BQ12829 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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