Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YOL162WYOL162W 648 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 SAD1YFR005C 1347 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 STE23YLR389C 3084 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 VAC8YEL013W 1737 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 HFM1YGL251C 3564 nt3.58□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 FLO9YAL063C 3969 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 PEX14YGL153W 1026 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 EFG1YGR271C-A 702 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YBL055CYBL055C 1257 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 SSU72YNL222W 621 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 POL2YNL262W 6669 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 TPT1YOL102C 693 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 TFC1YBR123C 1950 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 APA1YCL050C 966 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 ENA5YDR038C 3276 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 ENA2YDR039C 3276 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 ENA1YDR040C 3276 nt3.57□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RTG3YBL103C 1461 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 MAK11YKL021C 1407 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 CDC26YFR036W 375 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RPB9YGL070C 369 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YGL242CYGL242C 546 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 TDA8YAL064C-A 381 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 MIC27YNL100W 705 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 NIP7YPL211W 546 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.56□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RPA190YOR341W 4995 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YEL025CYEL025C 3567 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YNL011CYNL011C 1335 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YDL157CYDL157C 357 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RPN9YDR427W 1182 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YEL057CYEL057C 702 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YFH7YFR007W 1062 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 CMC1YKL137W 336 nt3.55□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 PAM1YDR251W 2493 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 MET5YJR137C 4329 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 AVT5YBL089W 1380 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 SEC4YFL005W 648 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YGR107WYGR107W 450 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YJL175WYJL175W 513 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YAR070CYAR070C 300 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 BNI4YNL233W 2679 nt3.54□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 HBT1YDL223C 3141 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 POL4YCR014C 1749 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 GCN1YGL195W 8019 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 SLS1YLR139C 1932 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 RPL13AYDL082W 600 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 COG7YGL005C 840 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YLR076CYLR076C 423 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 GIS2YNL255C 462 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YNL276CYNL276C 396 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 YOR387CYOR387C 621 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 TOM70YNL121C 1854 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 CIK1YMR198W 1785 nt3.53□□□□□ -1.84
RTP1Q12751 VAS1YGR094W 3315 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 DIA2YOR080W 2199 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 MAK5YBR142W 2322 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 PEX6YNL329C 3093 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 FMN1YDR236C 657 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPL24BYGR148C 468 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 DAL2YIR029W 1032 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPS28BYLR264W 204 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPL6BYLR448W 531 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 SUB1YMR039C 879 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 ARO4YBR249C 1113 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 AUS1YOR011W 4185 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPA135YPR010C 3612 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 TCP1YDR212W 1680 nt3.52□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YBR259WYBR259W 2067 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 EXO84YBR102C 2262 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 MIT1YEL007W 2001 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 DUF1YOL087C 3351 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPS8BYER102W 603 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YGL218WYGL218W 651 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 POL32YJR043C 1053 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPL8BYLL045C 771 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YLR169WYLR169W 354 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 TPM1YNL079C 600 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPS8AYBL072C 603 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 FRE8YLR047C 2061 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YPP1YGR198W 2454 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 STP2YHR006W 1626 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 VAC14YLR386W 2643 nt3.51□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 EPL1YFL024C 2499 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 TRM82YDR165W 1335 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 NOP4YPL043W 2058 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 PEX5YDR244W 1839 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YPD1YDL235C 504 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 TVP15YDR100W 432 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 GPN3YLR243W 819 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YNL320WYNL320W 855 nt3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.5 ms