Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YDR355CYDR355C 303 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YDR491CYDR491C 492 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MAM1YER106W 909 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 THG1YGR024C 714 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MRPL9YGR220C 810 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YHL026CYHL026C 948 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 TIM10YHR005C-A 282 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 ATG27YJL178C 816 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YJR020WYJR020W 333 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YJR087WYJR087W 351 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 PRM6YML047C 1059 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YOR365CYOR365C 2112 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 CTP1YBR291C 900 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 PMT6YGR199W 2280 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 ALA1YOR335C 2877 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 NOP56YLR197W 1515 nt3.6□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SPO23YBR250W 1572 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MTR4YJL050W 3222 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 MIX14YDR031W 366 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YDR157WYDR157W 402 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 RMD6YEL072W 696 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 PEA2YER149C 1263 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 LOC1YFR001W 615 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 SPT4YGR063C 309 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YLR050CYLR050C 486 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 YLR257WYLR257W 966 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 GRX7YBR014C 612 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 LOS1YKL205W 3303 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 RNR1YER070W 2667 nt3.59□□□□□ -1.83
HER1Q12276 ATG21YPL100W 1491 nt3.59□□□□□ -1.84
HER1Q12276 RAD4YER162C 2265 nt3.59□□□□□ -1.84
HER1Q12276 FAS1YKL182W 6156 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 CTM1YHR109W 1758 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 KRI1YNL308C 1776 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 ZDS2YML109W 2829 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 GCD2YGR083C 1956 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 GLC3YEL011W 2115 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 PPH3YDR075W 927 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YDR271CYDR271C 372 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 IRC18YJL037W 675 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YJR111CYJR111C 852 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 FYV7YLR068W 456 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 RLP7YNL002C 969 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 ATP11YNL315C 957 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 TSR4YOL022C 1227 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YPR136CYPR136C 513 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 TRS120YDR407C 3870 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 SWI1YPL016W 3945 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 VPS17YOR132W 1656 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YPL109CYPL109C 1974 nt3.58□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YBR225WYBR225W 2703 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 PWP2YCR057C 2772 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 RPS29BYDL061C 171 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 MSS4YDR208W 2340 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YGR051CYGR051C 324 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YIR014WYIR014W 729 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 ANB1YJR047C 474 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 ENT3YJR125C 1227 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 SPA2YLL021W 4401 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 BUR2YLR226W 1188 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 ASI1YMR119W 1875 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YNL046WYNL046W 519 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 PRM3YPL192C 402 nt3.57□□□□□ -1.84
HER1Q12276 BAR1YIL015W 1764 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 BYE1YKL005C 1785 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 STP1YDR463W 1560 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 BSC1YDL037C 987 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 TVP15YDR100W 432 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 FRQ1YDR373W 573 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YGR045CYGR045C 363 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 RSR1YGR152C 819 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 SDH3YKL141W 597 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 RAD14YMR201C 1116 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 LDS2YOL047C 1071 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 CDC5YMR001C 2118 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 TMA108YIL137C 2841 nt3.56□□□□□ -1.84
HER1Q12276 REB1YBR049C 2433 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 TOP1YOL006C 2310 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 ITT1YML068W 1395 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 HIS5YIL116W 1158 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 LSM1YJL124C 519 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 COQ9YLR201C 783 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 AIP1YMR092C 1848 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YLR352WYLR352W 2424 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 CHK1YBR274W 1584 nt3.55□□□□□ -1.84
HER1Q12276 CST9YLR394W 1449 nt3.54□□□□□ -1.84
HER1Q12276 ACK1YDL203C 1872 nt3.54□□□□□ -1.84
HER1Q12276 YDR008CYDR008C 351 nt3.54□□□□□ -1.84
HER1Q12276 DAD1YDR016C 285 nt3.54□□□□□ -1.84
HER1Q12276 AHA1YDR214W 1053 nt3.54□□□□□ -1.84
HER1Q12276 MSW1YDR268W 1140 nt3.54□□□□□ -1.84
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