Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELP6Q0PNE2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELP6Q0PNE2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELP6Q0PNE2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ELP6Q0PNE2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ELP6Q0PNE2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms