Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHHADHQ08426 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHHADHQ08426 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms