Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNB2Q08289 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms