Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TGM3Q08188 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms