Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF4Q08170 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms