Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POLEQ07864 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLEQ07864 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLEQ07864 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLEQ07864 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms