Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 PCA1YBR295W 3651 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 MGS1YNL218W 1764 nt4.57□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 PPN1YDR452W 2025 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 PAN1YIR006C 4443 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YDR115WYDR115W 318 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YDR340WYDR340W 303 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YHI9YHR029C 885 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 IRC18YJL037W 675 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 NIT2YJL126W 924 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YKL066WYKL066W 444 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 AFB1YLR040C 675 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 CTK3YML112W 891 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YOR082CYOR082C 342 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YPL107WYPL107W 747 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 TPK2YPL203W 1143 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 ROK1YGL171W 1695 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 CLF1YLR117C 2064 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 HXT14YNL318C 1623 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 FUI1YBL042C 1920 nt4.56□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 NDC80YIL144W 2076 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 PEX29YDR479C 1665 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 NUP116YMR047C 3342 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 SWF1YDR126W 1011 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YEL057CYEL057C 702 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YGL039WYGL039W 1047 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YGR269WYGR269W 327 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 VMA10YHR039C-A 345 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YIR020CYIR020C 303 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 BUD28YLR062C 378 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 AIM32YML050W 936 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 PHO88YBR106W 567 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 MBA1YBR185C 837 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 DER1YBR201W 636 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 EXO5YBR163W 1758 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 RNA14YMR061W 2034 nt4.55□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 SYO1YDL063C 1863 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 MNR2YKL064W 2910 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YFL015CYFL015C 495 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YGR025WYGR025W 303 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 RTS3YGR161C 792 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 RAD33YML011C 534 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 COQ10YOL008W 624 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 VAM10YOR068C 345 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 snR54snR54 86 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YKR078WYKR078W 1758 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 ADP1YCR011C 3150 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 EPO1YMR124W 2832 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 ULP1YPL020C 1866 nt4.54□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 STE24YJR117W 1362 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 SED4YCR067C 3198 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 ISW2YOR304W 3363 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 AAD4YDL243C 990 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 ECM34YHL043W 513 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 ABM1YJR108W 372 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YKL044WYKL044W 321 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YKL118WYKL118W 312 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 IDP2YLR174W 1239 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YMR320WYMR320W 306 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 MDG1YNL173C 1101 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 GRE2YOL151W 1029 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 YOP1YPR028W 543 nt4.53□□□□□ -1.68
HDA2Q06629 MUD2YKL074C 1584 nt4.53□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YOL153CYOL153C 1746 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 SFI1YLL003W 2841 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 NOP6YDL213C 678 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YDR149CYDR149C 708 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 HIT1YJR055W 495 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 ECM15YBL001C 315 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 AFT2YPL202C 1251 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 ICY2YPL250C 411 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 MSS18YPR134W 807 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 HFA1YMR207C 6372 nt4.52□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 PDR15YDR406W 4590 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 MCH4YOL119C 1506 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 HDA2YDR295C 2025 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 ABF1YKL112W 2196 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 DOA1YKL213C 2148 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YNL089CYNL089C 477 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 RRT16YNL105W 429 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YNL205CYNL205C 423 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YOL160WYOL160W 342 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 OST2YOR103C 393 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 TPS3YMR261C 3165 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 SWC4YGR002C 1431 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 PGS1YCL004W 1566 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 STE7YDL159W 1548 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 TGL4YKR089C 2733 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 MSH1YHR120W 2880 nt4.51□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 RAD16YBR114W 2373 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 CAF4YKR036C 1932 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 PSY4YBL046W 1326 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 SLK19YOR195W 2466 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YDL071CYDL071C 375 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 ATP8Q0080 147 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 JAC1YGL018C 555 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 MTM1YGR257C 1101 nt4.5□□□□□ -1.69
HDA2Q06629 YHL037CYHL037C 402 nt4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.6 ms