Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPAQ06546 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GABPAQ06546 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms