Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAP1Q03518 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAP1Q03518 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms