Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPCQ03188 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPCQ03188 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms