Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV1Q03135 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV1Q03135 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms