Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PAX2Q02962 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAX2Q02962 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms