Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4A11Q02928 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4A11Q02928 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms