Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC2Q02487 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DSC2Q02487 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms