Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNTN2Q02246 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN2Q02246 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms